生殖器疱疹（genital herpes）主要为hsv-2亚型感染所致，生殖器、会阴及外阴部周围的大腿和臀部皮肤均可受累，出现疱疹、溃疡及点状或片状糜烂。
男性患者多发生在龟头、包皮、阴茎等处，亦可累及阴囊。
患者可感局部疼痛不适，疱疹病毒感染所致前列腺炎，膀胱炎少见；但患者精液内仍可能检出病毒，hsv-2隐性感染可能导致男性不育。
女性患者则多见于大小阴唇、阴蒂、阴道、宫颈，亦可波及尿道。
一般而言生殖器疱疹，倘若损害仅局限于宫颈，患者症状可不明显。疱疹性宫颈炎可仅表现白带增多，甚至无症状。但外阴部疱疹损害常常导致局部及全身症状，如局部疼痛、感觉异常、尿路刺激症状、腹股沟淋巴结肿大、发热等。
生殖器疱疹患者的肛门直肠也可受累，尤见于有肛交史者，又称疱疹性直肠炎。
由于部位特殊，容易夹杂化脓性继发性感染，故疱疹性直肠炎的症状多较重。患者有肛门直肠痛，排便时尤为加重，常伴里急后重、发热、腹股沟淋巴结炎、反射性尿潴留、便秘等；或患者因疼痛而畏惧排便，导致便秘及排尿困难。查体可见肛周溃疡，有的患者虽肛门外观未见异常，但直肠镜检可发现直肠近端黏膜疱疹，脓疱疹或弥漫性糜烂损害。
严重的生殖器疱疹患者可并发无菌性脑膜炎或骶神经根脊髓炎，后者可导致神经痛。
由于外阴部的解剖特点，与其他部位皮肤黏膜疱疹相比，生殖器疱疹的病程较长，初发患者可达3~6周，且生殖器疱疹的复发更为常见。部分患者溃疡面愈合后可能导致阴唇粘连、尿道狭窄等后遗症。
孕妇罹患生殖器疱疹时还可能导致流产、早产或新生儿疱疹感染。
有研究认为，在宫颈癌等癌症的发生机制中，虽然人乳头状瘤病毒的感染更为重要，但仍可能与单纯疱疹病毒的感染存在某种相关关系。
需要强调的是生殖器疱疹，无论男女，许多生殖器疱疹患者病情很轻，可能无明显症状，成为未能及时就医的原因之一，并从而进一步传播给其性伴侣。
