原创 生物世界 Bio生物世界 收录于话题#HIV&艾滋病14个
撰文 | nagashi
编辑 | 王聪
排版 | 水成文
今天(12月1日)是世界艾滋病日,自1981年在美国首次发现艾滋病以来,全世界已有超过3600万人感染艾滋病,超过1200万人死于艾滋病,但人类从未停止与艾滋病的战斗。
艾滋病(AIDS)是一种由人类免疫缺陷病毒(HIV)引起的、危害性极大的传染病。HIV作为一种RNA病毒,其基因组具有极高的突变率,且随着HIV在人类世界的广泛传播,其衍生出来的亚型也越来越多,这也使得艾滋病的预防疫苗和治疗药物的开发变得十分困难。
鉴于全球HIV的多样性是复杂和不断变化的,因此,监测HIV的全球分子流行病学对于艾滋病毒疫苗的设计、测试和接种十分重要。
2019年2月,世界卫生组织和联合国艾滋病规划署等组成的国际团队在国际顶尖医学期刊《柳叶刀》子刊 The Lancet Infectious Disease 杂志上发表题为:Global and regional molecular epidemiology of HIV-1, 1990-2015: a systematic review, global survey, and trend analysis 的综述论文。
这篇综述性研究对1990-2015年全球HIV-1的分子流行病学进行了系统性调查分析,共生成了2203个数据集,383519个样本,覆盖全球116个国家,结果表明HIV-1的流行亚型在不同的国家、区域和全球的分布会随着时间的推移而不断改变。
全球HIV/AIDS大流行仍然是一个重大的全球公共卫生问题,据WHO统计,截至2017年,就已有3690万人感染艾滋病。更可怕的是,尽管抗逆转录病毒治疗方案得到推广,但在2017年,仍有94万人死于艾滋病。
HIV/AIDS大流行之所以如此难以遏制,原因在于其非凡的全球遗传多样性。自从20世纪初艾滋病毒由非人类灵长类动物传播给人类后,其在人类中衍生分化出许多不同的亚型,分别用字母A、B、C、D、F、G、H、J和K表示。不仅如此,亚型之间也形成了重组,即循环重组型(CRFs)或独特重组型(URFs)。
HIV-1的全球遗传多样性是开发HIV疫苗的主要障碍。艾滋病毒疫苗的设计、测试和接种需要了解世界各地HIV-1亚型和重组型分布的最新和准确情况,因此,相关的调查分析研究就显得十分重要。
在此项研究中,研究人员搜索了PubMed、EMBASE (Ovid)、CINAHL (Ebscohost)以及Global Health (Ovid)等数据库,共获得了覆盖全球116个国家、包含2203个数据集的383519个HIV-1亚型样本数据。时间跨度为1900年1月1日至2015年12月31日,并划分为1990-1999年、2000-2004年、2005-2009年和2010-2015年四个时间段。
本研究的流程图
整体而言,2010-2015年,在全球所有HIV-1感染患者中,C亚型占46.6%,而B亚型占12.1%,随之是A亚型——占10.3%,这三者占据HIV-1亚型感染的前三名,总体接近艾滋病感染患者的70%。
紧接着是,CRF02_AG——7.7%,CRF01_AE——5.3%,G亚型——4.6%hiv病毒,以及D亚型——2.7%。此外hiv病毒,F、H、J和K亚型则合并占据感染的0.9%。其他CRFs占3.7%,这也使得所有CRFs的比例达到16.7%。而URFs则占全球HIV-1感染总数的6.1%。
这意味着,HIV-1的重组亚型已占所有HIV-1感染的22.8%。
2010-2015年,HIV-1不同亚型、CRFs和URFs的全球比例
不仅如此,研究人员还发现,HIV-1的不同亚型和重组型在国家、区域和全球的分布会随着时间的变化而不断改变。
总体而言,2005-2015年,在全球范围内,B亚型感染占据的比例在不断增加,A和D亚型的感染比例较为稳定,而C、G亚型和CRF02_AG重组型则在不断减少。但与此同时,CRF01_AE以及其他CRFs和URFs的增加,整体上导致全球HIV-1重组型的感染比例在随时间持续增加。
1990-2015年,HIV-1不同亚型和重组型的统计数据
更重要的是,从研究的数据图上看,2010-2015年,东亚地区HIV-1的感染类型主要为CRF01_AE、B亚型以及其他CRFs和URFs,重组型感染比例甚至可超过80%。
2010-2015年HIV-1亚型、CRFs和URFs的区域分布
总而言之,这项全球性调查是迄今关于HIV-1亚型和重组型的全球和区域分布和变化趋势的最大一项研究,时间跨度为1990-2015年,覆盖116个国家,涉及383519个样本!
这项研究表明,在全球范围内,HIV-1的ABC亚型感染比例仍占据主要优势,但与此同时,CRF02_AG等重组型的比例也在不断上升,且在东亚和东南亚等地区,这一趋势更为明显。
HIV-1遗传多样性影响艾滋病预防和治疗的方方面面,包括艾滋病疫苗开发/测试/接种、艾滋病毒诊断检测、病毒载量检测以及献血者筛查管理等等。由此看来,实时监测全球HIV-1的不同亚型和重组型的变化趋势,对遏制和终结全球HIV/AIDS大流行是至关重要的。相信未来也会有更多的相关研究去揭示这一点!
论文链接:
(18)30647-9