对于肛门尖锐湿疣的病因，其内在原因是患者机体细胞免疫功能降低，外在原因可能与创面不透气、潮湿、易感染以及在行走和活动时容易受到摩擦损伤有关。但与尖锐湿疣一样，其主要传播的途径也有三种。
第一，性接触途径
直接性行为不仅是尖锐湿疣的主要途径，其他性病的主要途径也是如此。通常情况下，约有三分之二的肛门尖锐湿疣的患者的病因是进行肛交等高危性行，这是由于肛交非常容易擦伤直肠处的皮肤黏膜，有时候这种皮肤黏膜的擦伤并不是我们所想象的流血，即使是一些非常微小的皮肤裂口也会给病毒造成可乘之机。
第二，间接传染途径
这种病因主要是患者使用或者接触到尖锐湿疣患者的卫生用品以及与患者一起在桑拿浴室、浴池等处而感染，又或者患者接触到尖锐湿疣患者的分泌物因而间接性感染;
第三，自身感染途径
采用激光治疗也会促使肛周复发，从而HPV病毒就会乘着患者肝门的免疫力下降而侵袭，因而增加患上尖锐湿疣等疾病;
另外，痔疮经常发作、大便干燥也会容易患上肛门尖锐湿疣，痔疮的发作会降低局部皮肤的抗菌能力，增加尖锐湿疣的感染机会，而大便干燥会促使患者容易便秘，在便秘过程中容易促使皮肤黏膜的擦伤，因而也会增加感染几率。
早期肛门尖锐湿疣的症状并不明显，主要表现为患者感受到肛周灼痛、瘙痒及压迫感等，
在病情初发时，就能够见到少数微小淡红色丘疹逐渐增大、增多，倾向融合或互相重叠，并出现呈大小不等的菜花状、乳头状、蕈状或鹅冠状增殖，性质柔软，部分皮损根部可有蒂。由于分泌物浸润表面可呈白色、污灰色、红色或有出血表现肛门尖锐湿疣，颗粒间积有脓液、发出恶臭味。由于局部搔抓、摩擦肛门尖锐湿疣，可使疣体破损、表面糜烂而出现渗液、出血和继发感染，同时也能够明显看到疣体增长。
因此，患者一旦发现自己有类似的症状则需呀及时去医院接受治疗，越早治疗，则疗效也就越明显，目前关于治疗肛门尖锐湿疣主要采用化学疗法、物理疗法、免疫疗法的三联疗法，在治疗时需要到具备有一定条件的医疗机构，并需要在在专业医生的指导下才能进行治疗。但患者无论采用哪种治疗方案，都必须要进行醋酸白试验，尽量清除包括亚临床感染在内的损害，从而减小病情复发。
