小儿肺炎支原体感染的治疗一般主要是使用大环内酯类抗生素。小儿肺炎支原体感染后对大环内脂类的敏感性非常强，所以建议及时进行抗感染治疗，同时还需要进行对症治疗，比如：止咳祛痰等。小儿肺炎支原体感染通常指由肺炎支原体引起的呼吸道感染，可能有咽炎或支气管炎。严重的是支原体肺炎，对于肺炎支原体感染的治疗，早期使用适当的抗生素可以减轻症状，缩短病程。罗红霉素和大红霉素等抗生素是首选药物，呼吸道氟喹诺酮类药物，如左氧氟沙星和莫西沙星，以及四环素类药物也可用于治疗肺炎支原体感染。因为肺炎支原体没有细胞壁，青霉素和头孢菌素无效。症状一般是中度发烧，或不发烧，可伴有鼻咽和耳朵疼痛、呼吸短促或呼吸困难，在10%-20%的患者中，咽部和鼓膜充血、颈部淋巴结肿大或多形性红斑。
小儿肺炎支原体感染的疗程一般为2-3周，对于肺炎支原体感染的诊断，肺炎支原体的分离对诊断具有决定性意义，但其检出率低，技术要求高支原体感染，所需时间长。血清学检测有一定的参考价值，尤其是对血清抗体高4倍的患者，但大多为回顾性诊断。
建议注意多休息，多喝水，加强营养的摄入，有助于疾病的恢复。小儿肺炎支原体感染后，还需要及时进行呼吸道的隔离，避免发生传染。饮食方面尽量以清淡为主，减少辛辣刺激性食物的摄入。注意监测体温支原体感染，因为大部分小儿感染后会出现反复发热，必要时需要使用退热药物进行治疗。
