我们先来看看艾滋病毒在人细胞内复制过程（见下图）。艾滋病毒从进入到离开细胞要经历三个重要阶段：RNA逆转录为DNA（reverse transcription），DNA整合进入人基因组（integration），表达产物剪切成为各种蛋白质（cleavage）。现在艾滋病的治疗主要是针对这三个环节，即用抑制剂进行抑制，如用逆转录酶抑制剂，整合酶抑制剂和蛋白酶抑制剂。上述三个阶段被抑制住后，病毒的复制就终止，也就没有新的病毒产生，艾滋病毒的靶细胞CD4淋巴细胞数量就会回升，这样病情就会得到控制或治疗。
但在第二阶段即DNA整合进入人基因组后，病毒的基因组会持续存在于人细胞内艾滋病治愈，其寿命应该与人细胞一样长。这样的话，病毒复制的第三阶段即转录（transcription），翻译（translation) 和剪切(cleavage)就会不断被启动，只要停药或没有相应的抑制剂存在。这就决定了艾滋病的治疗是一个长期的过程或终身服药过程。
那么有人要问，整合进人基因组的病毒基因组就没有办法把它去除或失活？
回答是否定的，即现在还没有很好的方法，但我们也不必过于灰心，因为科学技术是在不断进步的。比如现在出现了基因编辑技术，其可以切除或修复有问题的基因。如果这项技术能够应用于切除整合的病毒基因组，那么艾滋病的治疗将会迎来一个崭新的时代艾滋病治愈，艾滋病朋友就不必终身服药，只要几个疗程就可彻底恢复健康。
